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SMART(http://smart.embl.de/)是我們常用來(lái)進(jìn)行domain搜索和蛋白質(zhì)注釋的數(shù)據(jù)庫(kù),它集成了很多蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和功能分析的工具,比如可以預(yù)測(cè)蛋白的一些二級(jí)結(jié)構(gòu):跨膜區(qū)(Transmembrane segments)、復(fù)合螺旋區(qū)(coiled coil regions)、信號(hào)肽(Signal peptides)、蛋白結(jié)構(gòu)域(PFAM domains)等。而此前小編剛好給大家介紹過(guò)如何進(jìn)行單序列或者批量domain鑒定(點(diǎn)擊了解一下)。其實(shí)通過(guò)單序列domian的預(yù)測(cè)也可以獲取該蛋白和
查看詳情 +GeneDoc是蛋白質(zhì)和DNA序列同源比較的輔助軟件,它不能對(duì)多個(gè)序列以某種算法進(jìn)行自動(dòng)比較,但是能對(duì)其他軟件的比較結(jié)果進(jìn)一步處理。如編輯和修改,用亮麗的色彩來(lái)區(qū)分相互間序列的同源性,并輸出各種漂亮的圖形格式。
查看詳情 +我們能不能僅用我們感興趣的基因繪制漂亮的KEGG代謝通路圖呢?就像下面這樣的!當(dāng)然,是我們自己做,而不是求助公司!答案是肯定的,今天小編就手把手教你自主繪制KEGG代謝通路圖!
查看詳情 +熱圖是屬于生命科學(xué)類型文章中非常常見(jiàn)的一種圖片了,但是它有一定的局限性:不能實(shí)現(xiàn)聚類分析。今天小編來(lái)教大家用一款簡(jiǎn)單不用安裝的小工具——MeV,在繪制熱圖時(shí)聚類、統(tǒng)計(jì)、細(xì)節(jié)設(shè)置更簡(jiǎn)單,圖片美觀度Up! Up! Up!
查看詳情 +系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)也稱為系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)、聚類樹(shù)或者進(jìn)化樹(shù)。它以樹(shù)狀結(jié)構(gòu)表示各個(gè)節(jié)點(diǎn)的進(jìn)化和親緣關(guān)系,枝點(diǎn)可以是物種和基因等,在系統(tǒng)發(fā)育分析、基因家族和物種進(jìn)化分析中經(jīng)常會(huì)看到,想要讓你的圖也像別人的那樣漂亮嗎?來(lái),我給你推薦一款強(qiáng)大好用的在線軟件繪圖工具—iTOL,讓你的論文也有顏值擔(dān)當(dāng)!
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