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科技服務(wù)

SCIENCE AND TECHNOLOGY SERVICE

環(huán)狀RNA測序

產(chǎn)品簡介

環(huán)狀RNA(circular RNA)是5’端和3’端共價結(jié)構(gòu)閉合環(huán)狀的非編碼RNA,是廣泛存在于動植物中的一種特殊的lncRNA,具有很高的保守性和組織特異性,獨特的環(huán)狀結(jié)構(gòu)使其不易被RNase降解,在胞內(nèi)具有較強的穩(wěn)定性。按其來源可分為內(nèi)含子CircRNA和外顯子CircRNA兩類,主要通過(1)作用于轉(zhuǎn)錄組因子,(2)競爭性結(jié)合miRNA,(3)結(jié)合核糖體誘導(dǎo)開環(huán)再重新表達等三種方式實現(xiàn)其調(diào)控基因表達的功能。CircRNA一經(jīng)發(fā)現(xiàn)就因其獨特的存在形式引起科學家的廣泛興趣,隨著近幾年測序技術(shù)的發(fā)展,CircRNA檢測技術(shù)亦日漸成熟。

研究內(nèi)容

1) 測序質(zhì)量值分布統(tǒng)計;

2) 測序堿基質(zhì)量控制;

3) 測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計;

4) 測序文庫質(zhì)量評估;

5) 與參考序列進行比對(比對效率統(tǒng)計;比對結(jié)果作圖);

6) CIRI識別環(huán)狀RNA;

7) circRNA的鑒定;

8) circRNA的統(tǒng)計;

9) circRNA來源基因功能注釋;

10) circRNA表達定量分析(定量及統(tǒng)計);

11) 聚類分析;

12) 樣品間circRNA相關(guān)性分析(含生物學重復(fù)樣品);

13) circRNA差異表達分析;

14) 差異表達circRNA數(shù)目統(tǒng)計及聚類分析;

15) 差異表達circRNA來源基因的功能注釋(NR,GO,KEGG等)及富集分析;

16) 差異表達circRNA來源基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析。

結(jié)果展示

送樣建議

1) 樣品類型:總RNA;
2) 樣品濃度:≥50ng/μg;
3) RNA總量:≥3μg;
4) RNA純度:OD260/280:1.8-2.0;OD260/230≥1.8,260處有正常峰值;
5) RNA完整度:電泳檢測28s/18s≥1.5或RIN≥7.5(動物)、7(植物、真菌),基線平整(軟體等無28S物種)。


010-80543251

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