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產(chǎn)品簡介
Small RNA是一類長度在18-30nt范圍的調(diào)控因子,在基因表達調(diào)控、生物個體發(fā)育、代謝及疾病的發(fā)生等生理過程中起著重要的作用。
研究內(nèi)容
1) 測序質(zhì)量值分布統(tǒng)計;
2) 測序堿基質(zhì)量控制;
3) 測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計;
4) 樣品間公共及特有序列分析(兩個或兩個樣品以上);
5) 與參考序列進行比對;
6) 與相關(guān)生物數(shù)據(jù)庫(miRBASE、RepBASE、Rfam、SILVA、ncRNAs等)及參考基因組比對,分類注釋Small RNA;
7) miRNA鑒定:已知miRNA鑒定;
8) miRNA長度分布分析;
9) miRNA基因組分布分析(針對有ref物種);
10) 預(yù)測新miRNA及二級結(jié)構(gòu)模式圖繪制;
11) miRNA堿基偏好性分析;
12) miRNA堿基編輯分析;
13) miRNA家族分析;
14) miRNA定量分析;
15) miRNA差異表達分析:重復(fù)相關(guān)性檢測;差異表達篩選;差異表達miRNA統(tǒng)計;
16) 差異表達miRNA篩選;
17) 差異表達miRNA聚類分析;
18) miRNA靶基因預(yù)測;
19) 差異表達miRNA靶基因注釋;
20) 差異表達miRNA靶基因的GO分類;
21) 差異miRNA靶基因GO富集層次分析;
22) 差異miRNA靶基因的COG注釋;
23) 差異miRNA靶基因KEGG注釋;
結(jié)果展示
送樣建議
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