產(chǎn)品簡介
完整的轉(zhuǎn)錄本包括了從5’端到3’端polyA尾的序列，長度集中分布在1-6kb。二代測序技術(shù)由于讀長較短，得到的測序片段需要拼接，得到的轉(zhuǎn)錄本可能會產(chǎn)生拼接錯誤和較多的嵌合體，從而不能得到完整的轉(zhuǎn)錄本。第三代測序技術(shù)Pacbio利用單分子實(shí)時測序技術(shù)（SMRT），由于其超長的讀長（平均15kb），無需拼接即可直接獲取完整的全長轉(zhuǎn)錄本，因此可得到更高質(zhì)量的轉(zhuǎn)錄本，有利于mRNA結(jié)構(gòu)的研究，如可變剪切、融合基因、等位基因表達(dá)等。
研究內(nèi)容
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有參全長轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)容
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無參全長轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)容
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1) 數(shù)據(jù)質(zhì)控、轉(zhuǎn)錄本分類；
2) 轉(zhuǎn)錄本聚類與校正；
3) 與參考基因組比對；
4) 進(jìn)行可變剪切分析；
5) 新基因預(yù)測；
6) 融合基因分析；
7) 作為參考序列，定量分析；
8) 編碼蛋白框預(yù)測；
9) lncRNA預(yù)測。
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1) 數(shù)據(jù)質(zhì)控、轉(zhuǎn)錄本分類；
2) 轉(zhuǎn)錄本聚類與校正；
3) 七大轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫注釋；
4) 作為參考序列、定量分析；
5) lncRNA預(yù)測；
6) 編碼蛋白框預(yù)測。
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結(jié)果展示
送樣建議
1) 樣品類型：組織樣或總RNA；
2) 樣品濃度：≥300ng/μg；
3) RNA總量：≥10μg；
4) RNA純度：OD260/280：1.8-2.0；OD260/230≥1.8，260處有正常峰值；
5) RNA完整度：電泳檢測28s/18s≥1.5或RIN≥8，基線平整（軟體等無28S物種）。
