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產(chǎn)品簡介
細(xì)菌基因組一般較小,約10M以內(nèi),可采用三代測序技術(shù),對細(xì)菌基因組進(jìn)行測序、拼接、組裝,獲得完整細(xì)菌基因信息,細(xì)菌基因組研究不僅有利于研究細(xì)菌的基本生命過程, 同時(shí)也對高等真核生物的基因組學(xué)及后基因組學(xué)研究提供了參考。
研究內(nèi)容
1) 數(shù)據(jù)質(zhì)控
2) 基因組初步組裝
3) 基因組情況評估
4) 基因組組分分析
編碼基因預(yù)測;重復(fù)序列注釋;非編碼RNA預(yù)測;假基因分析;細(xì)菌基因島預(yù)測;前噬菌體預(yù)測;CRISPR序列預(yù)測;
5) 基因組圈圖
6) 基因功能注釋
通用數(shù)據(jù)庫注釋:GO, KEGG, COG, Swiss-prot, Nr, KOG, pfam;
7) 比較基因組學(xué)分析
結(jié)果展示
送樣建議
1) 菌體送樣:收集生長對數(shù)期菌體,收集離心菌體數(shù)3×10*10 個(gè),無菌離心管,液氮速凍,干冰運(yùn)輸。
2) DNA濃度 ≥20ng/μl(Qubit),DNA質(zhì)量≥15ug(Qubit)DNA電泳條帶單一,無明顯降解。
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